Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd1Q04519 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd1Q04519 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms