Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col6a2Q02788 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms