Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnb1Q02248 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms