Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms