Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.1 ms