Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax8Q00288 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms