Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms