Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp6P97868 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms