Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Etv6P97360 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms