Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms