Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mesp1P97309 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms