Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms