Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tp53bp1P70399 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms