Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncoa1P70365 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ncoa1P70365 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa1P70365 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms