Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NficP70255 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NficP70255 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NficP70255 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NficP70255 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NficP70255 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NficP70255 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NficP70255 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NficP70255 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NficP70255 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NficP70255 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NficP70255 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NficP70255 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NficP70255 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NficP70255 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NficP70255 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms