Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps25P62852 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps25P62852 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms