Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms