Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga11P61622 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga11P61622 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga11P61622 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga11P61622 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms