Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pcif1P59114 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms