Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhbdl3P58873 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl3P58873 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms