Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpdl3bP58242 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpdl3bP58242 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms