Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace1P56818 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace1P56818 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace1P56818 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace1P56818 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace1P56818 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace1P56818 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms