Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GemP55041 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GemP55041 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GemP55041 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GemP55041 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GemP55041 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GemP55041 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GemP55041 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GemP55041 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GemP55041 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GemP55041 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GemP55041 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GemP55041 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GemP55041 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GemP55041 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GemP55041 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GemP55041 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GemP55041 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GemP55041 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GemP55041 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GemP55041 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GemP55041 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GemP55041 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GemP55041 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GemP55041 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GemP55041 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GemP55041 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GemP55041 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GemP55041 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GemP55041 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GemP55041 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GemP55041 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GemP55041 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GemP55041 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GemP55041 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GemP55041 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GemP55041 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GemP55041 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GemP55041 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GemP55041 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GemP55041 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GemP55041 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GemP55041 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GemP55041 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GemP55041 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GemP55041 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GemP55041 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms