Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acod1P54987 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms