Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApodP51910 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApodP51910 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApodP51910 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApodP51910 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApodP51910 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApodP51910 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApodP51910 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApodP51910 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms