Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rpl28P41105 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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