Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtlP38585 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtlP38585 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtlP38585 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtlP38585 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TtlP38585 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtlP38585 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TtlP38585 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtlP38585 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtlP38585 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtlP38585 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtlP38585 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtlP38585 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtlP38585 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms