Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Flt1P35969 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flt1P35969 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flt1P35969 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Flt1P35969 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms