Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpardP35396 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpardP35396 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpardP35396 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpardP35396 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpardP35396 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpardP35396 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpardP35396 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpardP35396 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpardP35396 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpardP35396 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpardP35396 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpardP35396 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpardP35396 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpardP35396 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpardP35396 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpardP35396 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpardP35396 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms