Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn11P35235 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms