Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnd1P30999 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnnd1P30999 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms