Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcam1P29533 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcam1P29533 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms