Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HexaP29416 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HexaP29416 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HexaP29416 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HexaP29416 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HexaP29416 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HexaP29416 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HexaP29416 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HexaP29416 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HexaP29416 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HexaP29416 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HexaP29416 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HexaP29416 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HexaP29416 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HexaP29416 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms