Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aco1P28271 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aco1P28271 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aco1P28271 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms