Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms