Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox5bP19536 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox5bP19536 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms