Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ifrd1P19182 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd1P19182 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms