Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calb1P12658 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb1P12658 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms