Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms