Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Tnp1P10856 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms