Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6c1P0CW02 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ly6c1P0CW02 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms