Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApoeP08226 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApoeP08226 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms