Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01820 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01820 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01820 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01820 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01820 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01820 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01820 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01820 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01820 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01820 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01820 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01820 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01820 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01820 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01820 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01820 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01820 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01820 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms