Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01649 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01649 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01649 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01649 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01649 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01649 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01649 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01649 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01649 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms