Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01648 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01648 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01648 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01648 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01648 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01648 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01648 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01648 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01648 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01648 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01648 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01648 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01648 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01648 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01648 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01648 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01648 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01648 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01648 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01648 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01648 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01648 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01648 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01648 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01648 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms