Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01643 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01643 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01643 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01643 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01643 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01643 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01643 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01643 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01643 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms