Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkcO88445 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AurkcO88445 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AurkcO88445 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AurkcO88445 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AurkcO88445 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AurkcO88445 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms