Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms