Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf12O54907 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms