Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Emp3O35912 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms